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病原微生物宏基因组检测

| 配景概述

熏染性疾�。ㄒ渤蒲静。┦侨蚍⒉÷屎烷婷首罡叩募膊≈�。病原体熏染的重大多样，新发病原体的一直涌现，细菌耐药的严肃形势，老熏染病死灰复燃等，给熏染性疾病防控诊疗带来了重大挑战。在临床诊疗方面，约有20-60%的重症肺炎，发热待查，脓毒血症和中枢神经系统熏染患者不可明确熏染病原体，造成严重的医疗，经济和社会肩负。因此，快速、准确的病原体判断是有用治疗、病情监测和控制疾病伸张的主要条件!

古板的病原微生物检测要领主要包括形态学检测、作育疏散、生化检测、免疫学和核酸检测。因操作简朴、快速、手艺要求不高，同时具有一定的诊断敏感性和特异性，现在仍在临床上普遍使用。但古板的检测要领在敏感性、特异性、时效性、信息量等方面保存局限，并且关于未知或者有数的病原微生物，无法快速识别。

宏基因组测序(metagenomics next generation sequencing, mNGS)手艺不依赖于古板的微生物作育，直接对全血、肺泡灌洗液、脑脊液等临床标本中的核酸举行高通量测序，通过与微生物参考序列数据库举行比对剖析，获得疑似致病微生物的种属信息。mNGS无需特异性扩增，无偏向性地快速判断细菌、真菌、病毒和寄生虫等病原体，在未知或有数病原体判断、耐药基因谱剖析、混淆病原菌熏染检测等方面展现出辽阔的应用远景，尤其适用于急危重症和疑难熏染的诊断。

| 服务内容

检测规模：接纳mNGS手艺对临床标本核酸举行广谱的病原微生物筛查，可检测规模包括基因组序列已知的12818+种微生物，包括细菌（含分枝杆菌、支原体/衣原体）、真菌、DNA病毒、寄生虫等。

可检测病原体种类	种类数目
细菌	6600+
真菌	986+
DNA病毒	2303+
RNA病毒	2707+
寄生虫	222+
合计	12818+

检测顺应症：

① 疑“难”：恒久不明缘故原由发热，熏染病因不明；

② 危“重”：重症肺炎、脑膜炎，脓毒血症等；

③ “特”殊：器官移植、肿瘤患者、免疫缺陷患者等特殊人群；

| 检测周期

自实验室收到标本确认及格后，1-2个事情日出具检测报告

| 检测优势/适用人群

产品优势：

1、自主开发，专业剖析，权威解读

1) 自主开发的核酸提取试剂盒，笼罩多种标本类型，可实现微生物的高效提��；

2) 自主开发的宏基因组信息剖析软件，实现高效专业的生信剖析，接纳双重人工复核，高校区分真假阳性病原体；

3) 综合参考多个权威数据库和大宗的文献资料，建设微生物参考序列和微生物致病信息解读两大专业数据库息争读报告软件，实现病原微生物的快速识别息争读；

2、两大平台，强强团结，准确可靠

NGS+qPCR两大平台，强强团结，相互验证，提高阳性检出率和准确性。

| 样本类型

标本类型	标本体积	贮存及运输条件
外周血	3-5ml	常温（15-25℃）生涯及运输，2天内送检
肺泡灌洗液	3ml以上	DNA检测：-20℃生涯1周，-80℃恒久生涯，阻止重复冻融；冰袋/干冰运输。 RNA检测：-80℃生涯，阻止重复冻融；添加生涯液，2-8℃冰袋运输。
脑脊液	3ml以上
尿液	10ml
其他体液	3ml以上
实体组织	绿豆巨细